Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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BEST4Q8NFU0 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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BEST4Q8NFU0 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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BEST4Q8NFU0 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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BEST4Q8NFU0 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
BEST4Q8NFU0 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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