Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CSNK2A3Q8NEV1 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms