Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEL0

CCDC54, Coiled-coil domain-containing protein 54, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC54Q8NEL0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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CCDC54Q8NEL0 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC54Q8NEL0 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC54Q8NEL0 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC54Q8NEL0 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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CCDC54Q8NEL0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC54Q8NEL0 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC54Q8NEL0 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC54Q8NEL0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC54Q8NEL0 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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CCDC54Q8NEL0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC54Q8NEL0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC54Q8NEL0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC54Q8NEL0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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CCDC54Q8NEL0 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC54Q8NEL0 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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CCDC54Q8NEL0 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC54Q8NEL0 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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CCDC54Q8NEL0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC54Q8NEL0 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC54Q8NEL0 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC54Q8NEL0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CCDC54Q8NEL0 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CCDC54Q8NEL0 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC54Q8NEL0 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC54Q8NEL0 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC54Q8NEL0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CCDC54Q8NEL0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC54Q8NEL0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CCDC54Q8NEL0 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC54Q8NEL0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CCDC54Q8NEL0 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CCDC54Q8NEL0 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CCDC54Q8NEL0 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CCDC54Q8NEL0 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CCDC54Q8NEL0 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC54Q8NEL0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC54Q8NEL0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC54Q8NEL0 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC54Q8NEL0 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC54Q8NEL0 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC54Q8NEL0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC54Q8NEL0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC54Q8NEL0 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC54Q8NEL0 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC54Q8NEL0 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC54Q8NEL0 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC54Q8NEL0 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC54Q8NEL0 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC54Q8NEL0 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC54Q8NEL0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC54Q8NEL0 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC54Q8NEL0 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC54Q8NEL0 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC54Q8NEL0 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC54Q8NEL0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCDC54Q8NEL0 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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