Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAV2

C8orf58, Uncharacterized protein C8orf58, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf58Q8NAV2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C8orf58Q8NAV2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms