Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LMNTD2Q8IXW0 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LMNTD2Q8IXW0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms