Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NPAS3Q8IXF0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms