Protein–RNA interactions for Protein: Q86YW5

TREML1, Trem-like transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML1Q86YW5 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TREML1Q86YW5 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms