Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
WDR53Q7Z5U6 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms