Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP54Q7Z3B4 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms