Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BHLHA9Q7RTU4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms