Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNDC1Q76NI1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNDC1Q76NI1 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNDC1Q76NI1 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNDC1Q76NI1 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KNDC1Q76NI1 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNDC1Q76NI1 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNDC1Q76NI1 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNDC1Q76NI1 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KNDC1Q76NI1 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KNDC1Q76NI1 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNDC1Q76NI1 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNDC1Q76NI1 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNDC1Q76NI1 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNDC1Q76NI1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNDC1Q76NI1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNDC1Q76NI1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNDC1Q76NI1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNDC1Q76NI1 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNDC1Q76NI1 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNDC1Q76NI1 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNDC1Q76NI1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNDC1Q76NI1 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNDC1Q76NI1 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNDC1Q76NI1 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNDC1Q76NI1 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNDC1Q76NI1 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KNDC1Q76NI1 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNDC1Q76NI1 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNDC1Q76NI1 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNDC1Q76NI1 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KNDC1Q76NI1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KNDC1Q76NI1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KNDC1Q76NI1 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms