Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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USP43Q70EL4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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USP43Q70EL4 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP43Q70EL4 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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USP43Q70EL4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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USP43Q70EL4 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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USP43Q70EL4 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP43Q70EL4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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