Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMARCD3Q6STE5 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms