Protein–RNA interactions for Protein: Q6B0B8

TIGD3, Tigger transposable element-derived protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD3Q6B0B8 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TIGD3Q6B0B8 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TIGD3Q6B0B8 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TIGD3Q6B0B8 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TIGD3Q6B0B8 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TIGD3Q6B0B8 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TIGD3Q6B0B8 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TIGD3Q6B0B8 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TIGD3Q6B0B8 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TIGD3Q6B0B8 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TIGD3Q6B0B8 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TIGD3Q6B0B8 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIGD3Q6B0B8 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIGD3Q6B0B8 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TIGD3Q6B0B8 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIGD3Q6B0B8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIGD3Q6B0B8 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIGD3Q6B0B8 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIGD3Q6B0B8 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIGD3Q6B0B8 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIGD3Q6B0B8 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIGD3Q6B0B8 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIGD3Q6B0B8 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIGD3Q6B0B8 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIGD3Q6B0B8 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIGD3Q6B0B8 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIGD3Q6B0B8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIGD3Q6B0B8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIGD3Q6B0B8 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIGD3Q6B0B8 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIGD3Q6B0B8 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms