Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SAMD13Q5VXD3 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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