Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FRMPD1Q5SYB0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FRMPD1Q5SYB0 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms