Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms