Protein–RNA interactions for Protein: Q56A73

SPIN4, Spindlin-4, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN4Q56A73 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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SPIN4Q56A73 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SPIN4Q56A73 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SPIN4Q56A73 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SPIN4Q56A73 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SPIN4Q56A73 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SPIN4Q56A73 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIN4Q56A73 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIN4Q56A73 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIN4Q56A73 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIN4Q56A73 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIN4Q56A73 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIN4Q56A73 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPIN4Q56A73 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SPIN4Q56A73 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SPIN4Q56A73 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SPIN4Q56A73 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIN4Q56A73 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SPIN4Q56A73 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIN4Q56A73 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SPIN4Q56A73 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIN4Q56A73 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIN4Q56A73 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SPIN4Q56A73 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIN4Q56A73 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIN4Q56A73 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIN4Q56A73 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIN4Q56A73 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIN4Q56A73 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIN4Q56A73 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIN4Q56A73 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIN4Q56A73 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIN4Q56A73 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIN4Q56A73 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIN4Q56A73 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIN4Q56A73 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIN4Q56A73 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIN4Q56A73 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIN4Q56A73 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIN4Q56A73 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIN4Q56A73 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIN4Q56A73 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIN4Q56A73 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIN4Q56A73 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIN4Q56A73 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIN4Q56A73 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIN4Q56A73 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPIN4Q56A73 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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