Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ALFQ53S48 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms