Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PDLIM3Q53GG5 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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