Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
C4orf17Q53FE4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms