Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms