Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MICAQ29983 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MICAQ29983 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MICAQ29983 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MICAQ29983 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MICAQ29983 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MICAQ29983 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MICAQ29983 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MICAQ29983 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MICAQ29983 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MICAQ29983 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MICAQ29983 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MICAQ29983 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MICAQ29983 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MICAQ29983 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MICAQ29983 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MICAQ29983 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MICAQ29983 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MICAQ29983 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MICAQ29983 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MICAQ29983 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MICAQ29983 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MICAQ29983 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MICAQ29983 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MICAQ29983 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MICAQ29983 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MICAQ29983 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MICAQ29983 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MICAQ29983 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MICAQ29983 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MICAQ29983 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MICAQ29983 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MICAQ29983 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MICAQ29983 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MICAQ29983 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MICAQ29983 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MICAQ29983 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MICAQ29983 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MICAQ29983 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MICAQ29983 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MICAQ29983 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MICAQ29983 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MICAQ29983 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MICAQ29983 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MICAQ29983 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MICAQ29983 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MICAQ29983 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MICAQ29983 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MICAQ29983 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MICAQ29983 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MICAQ29983 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MICAQ29983 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MICAQ29983 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MICAQ29983 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MICAQ29983 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MICAQ29983 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MICAQ29983 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MICAQ29983 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MICAQ29983 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MICAQ29983 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MICAQ29983 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MICAQ29983 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MICAQ29983 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MICAQ29983 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms