Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
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RTL8BQ17RB0 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RTL8BQ17RB0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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