Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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PTPROQ16827 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPROQ16827 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
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