Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIST3H3Q16695 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIST3H3Q16695 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms