Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PCSK7Q16549 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms