Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GRIK4Q16099 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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