Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS72Q15906 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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