Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ALX1Q15699 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ALX1Q15699 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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