Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TWIST1Q15672 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms