Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIP4Q15650 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIP4Q15650 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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