Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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NECTIN1Q15223 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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