Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
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CHD4Q14839 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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CHD4Q14839 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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CHD4Q14839 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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CHD4Q14839 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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CHD4Q14839 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHD4Q14839 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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