Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA3AQ14563 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA3AQ14563 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms