Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERV3-1Q14264 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms