Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CKAP5Q14008 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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