Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DDX39BQ13838 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DDX39BQ13838 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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