Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CUL4BQ13620 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CUL4BQ13620 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
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