Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPS1Q13098 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPS1Q13098 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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