Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

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Length 2,346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACACAQ13085 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACACAQ13085 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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