Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MKRN3Q13064 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms