Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms