Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms