Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXOSC9Q06265 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms