Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC18A2Q05940 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms