Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNEQ04844 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms