Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CENPCQ03188 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms