Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP27A1Q02318 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms