Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms